1999和2000年，《工程數學學報》兩次榮獲“陜西省優秀科技期刊一等獎”。

　　2002年，被陜西省科學技術廳授予年度陜西省科學技術類優秀期刊。

　　2014年，獲第三屆陜西省科技期刊優秀獎。

　　Caj-cd規范獲獎期刊

　　《中文核心期刊要目總覽》核心期刊

　　《中國科學引文數據庫》核心期刊

　　《中國數學文摘》核心期刊