《華東理工大學學報(自然科學版)》被國家新聞出版總署評為“中國期刊方陣科技雙效(社會效益與經濟效益)期刊”; 2010年以來多次獲得中國高校優秀科技期刊獎、中國高校精品科技期刊獎以及全國石油和化工行業優秀報刊一等獎。在上海市新聞出版局組織的編輯質量檢查中多次獲得優秀獎。