《四川大學學報(醫學版)》部分獲獎獎項

　　1989年 全國高等學校自然科學學報優秀編輯質量一等獎

　　1990年 四川省首屆科學技術期刊優秀期刊一等獎

　　1993年 四川省第二屆科學技術期刊評比優秀期刊一等獎

　　1995年 四川省十佳科技期刊

　　1997年 第二屆全國優秀科技期刊評比一等獎

　　1999年 首屆國家期刊獎提名獎

　　2002年 第二屆國家期刊獎百種重點期刊獎

　　2010年 教育廳首屆四川省高校精品科技期刊

　　2011年 教育部中國高校科技期刊優秀團隊

　　2006年-2014年 連續五屆教育部中國高校精品科技期刊

　　2015年 中國國際影響力優秀學術期刊

　　2018年 中國高校編輯出版質量優秀科技期刊

　　2019年 四川省高校精品科技期刊

　　2020年 中國高校百佳科技期刊

　　2021年 入選首屆“方正電子”杯中國期刊設計藝術周優秀版式設計

　　2022年 第三屆川渝年度一流期刊

　　2024年 “西牛計劃”優秀中文科技期刊